Trong quá trình mở rộng kinh doanh, nhiều doanh nghiệp tại Việt Nam gặp khó khăn khi phải báo cáo thuế cho nhiều chi nhánh, đặc biệt là khi mỗi chi nhánh hoạt động tại địa phương khác nhau. Việc kê khai không đúng quy định có thể dẫn đến bị xử phạt, chậm trễ thanh toán thuế và ảnh hưởng đến uy tín doanh nghiệp.
Bài viết này của Luật và Kế toán An Khang sẽ hướng dẫn chi tiết về cách kê khai thuế cho doanh nghiệp nhiều chi nhánh, giúp bạn nắm vững quy định báo cáo thuế chi nhánh công ty, tránh rủi ro pháp lý và tối ưu hóa nghĩa vụ thuế. Hãy cùng tìm hiểu các bước thực tế, hồ sơ cần chuẩn bị và các căn cứ pháp lý hiện hành để doanh nghiệp bạn luôn an tâm khi nộp thuế.
Doanh nghiệp có nhiều chi nhánh thì báo cáo thuế chung hay riêng?
Theo Thông tư 156/2013/TT-BTC, doanh nghiệp mở chi nhánh có thể phân thành chi nhánh hạch toán phụ thuộc hoặc chi nhánh hạch toán độc lập:
- Chi nhánh hạch toán phụ thuộc:
- Không lập báo cáo tài chính riêng, sử dụng báo cáo của công ty mẹ.
- Báo cáo thuế được thực hiện tập trung tại công ty mẹ.
- Thủ tục báo cáo thuế chi nhánh hạch toán phụ thuộc giống như báo cáo của trụ sở chính, chỉ cần phân bổ doanh thu, chi phí theo từng chi nhánh để quản lý nội bộ.
- Chi nhánh hạch toán độc lập:
- Có mã số thuế riêng, báo cáo thuế trực tiếp với cơ quan thuế tại địa phương.
- Phải thực hiện đầy đủ các tờ khai thuế GTGT, TNDN, TNCN, và báo cáo tài chính theo quy định.
Lưu ý: Việc xác định loại chi nhánh ảnh hưởng trực tiếp đến cách nộp thuế GTGT khi có nhiều chi nhánh, cách phân bổ lợi nhuận và trách nhiệm kê khai thuế.
Kê khai và nộp thuế GTGT cho chi nhánh
Thuế giá trị gia tăng (GTGT) là loại thuế doanh nghiệp phải kê khai định kỳ. Khi doanh nghiệp có nhiều chi nhánh, cần lưu ý 3 điểm sau:
Chi nhánh hạch toán phụ thuộc:
- Nếu cùng tỉnh, không trực tiếp bán hàng, không dùng hóa đơn riêng → không phải kê khai GTGT riêng, doanh thu được kê khai tập trung tại công ty mẹ.
- Nếu khác tỉnh, trực tiếp bán hàng, có hóa đơn riêng → phải kê khai/nộp GTGT tại cơ quan thuế quản lý chi nhánh hoặc phân bổ theo quy định.
- Căn cứ pháp lý: Điều 13, Điều 14 Thông tư 80/2021/TT-BTC.
Chi nhánh hạch toán độc lập:
- Có mã số thuế riêng, trực tiếp bán hàng, sử dụng hóa đơn riêng → phải lập tờ khai và nộp thuế GTGT tại cơ quan thuế quản lý chi nhánh.
- Căn cứ pháp lý: Thông tư 80/2021/TT-BTC
Các bước kê khai GTGT:
- Bước 1: Xác định loại chi nhánh (phụ thuộc hay độc lập).
- Bước 2: Lập hóa đơn GTGT đúng quy định.
- Bước 3: Nộp tờ khai GTGT theo kỳ (tháng/quý).
- Bước 4: Lưu trữ hồ sơ theo quy định tại Điều 16 Luật Quản lý Thuế 2019.
Thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) với nhiều chi nhánh
TNDN được tính dựa trên lợi nhuận của doanh nghiệp. Khi doanh nghiệp có nhiều chi nhánh:
- Chi nhánh phụ thuộc: lợi nhuận được tập trung về công ty mẹ, công ty mẹ thực hiện kê khai và nộp thuế.
- Chi nhánh độc lập: mỗi chi nhánh lập báo cáo tài chính riêng, nộp TNDN tại địa phương.
Phân bổ chi phí và doanh thu:
- Chi nhánh phụ thuộc cần lập sổ phân bổ doanh thu, chi phí, lợi nhuận để báo cáo nội bộ.
- Căn cứ pháp lý: Thông tư 80/2021/TT-BTC hướng dẫn về kê khai TNDN tại doanh nghiệp có chi nhánh.
Việc phân bổ không đúng có thể dẫn đến xử phạt vi phạm thuế, theo Điều 10 Nghị định 125/2020/NĐ-CP.
Thuế thu nhập cá nhân (TNCN) cho nhân viên tại chi nhánh
Nhân viên làm việc tại chi nhánh phải nộp TNCN theo 2 nguyên tắc:
- Chi nhánh hạch toán phụ thuộc: công ty mẹ quyết toán TNCN cho toàn bộ nhân viên.
- Chi nhánh hạch toán độc lập: chi nhánh quyết toán TNCN tại địa phương.
Hồ sơ quyết toán:
- Tờ khai 05/KK-TNCN được ban hành tại Phụ lục II Thông tư 80/2021/TT-BTC.
- Báo cáo quyết toán TNCN phải nộp trước ngày 31/03 hàng năm, căn cứ Luật Quản lý Thuế 2019.
>>>Xem thêm: Hướng Dẫn Kê Khai Thuế Hộ Kinh Doanh Cá Thể Mới Nhất 2025
Hồ sơ và thủ tục báo cáo thuế chi nhánh
Để kê khai và nộp thuế đúng quy định, doanh nghiệp cần chuẩn bị:
- Tờ khai thuế GTGT, TNDN, TNCN theo mẫu quy định.
- Bảng kê hóa đơn, chứng từ phát sinh tại chi nhánh.
- Sổ phân bổ chi phí, doanh thu (với chi nhánh phụ thuộc).
- Hồ sơ kê khai thuế cho chi nhánh mới thành lập:
- Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh chi nhánh.
- Thông báo mã số thuế (nếu hạch toán độc lập).
- Quyết định bổ nhiệm kế toán trưởng chi nhánh.
- Căn cứ pháp lý: Điều 28 Thông tư 156/2013/TT-BTC.
Thời hạn nộp:
- Thuế GTGT, TNCN: theo tháng/quý.
- TNDN: theo quý, quyết toán năm.
- Báo cáo tài chính.
Rủi ro và xử phạt khi kê khai sai hoặc chậm nộp báo cáo thuế
Việc không tuân thủ quy định báo cáo thuế chi nhánh công ty có thể dẫn đến:
- Phạt tiền 20% trên số tiền thuế kê khai sai (theo Điều 16 Nghị định 125/2020/NĐ-CP).
- Bị truy thu thuế GTGT, TNDN, TNCN chưa nộp.
- Ảnh hưởng đến uy tín công ty khi cơ quan thuế kiểm tra.
Khuyến nghị: Luôn kiểm tra hồ sơ trước khi nộp, theo dõi lịch trình nộp thuế định kỳ, và nếu cần, sử dụng dịch vụ của luật sư hoặc kế toán uy tín để tránh rủi ro pháp lý.
Kết luận
Việc báo cáo thuế khi doanh nghiệp có nhiều chi nhánh tưởng chừng đơn giản nhưng lại tiềm ẩn nhiều rủi ro nếu không nắm vững quy định. Từ việc xác định loại chi nhánh, kê khai GTGT, TNDN, TNCN, đến việc chuẩn bị hồ sơ cho chi nhánh mới thành lập, mọi bước đều cần tuân thủ pháp luật hiện hành để tránh bị xử phạt. Luật và Kế toán An Khang khuyến nghị doanh nghiệp nắm rõ cách kê khai thuế cho doanh nghiệp nhiều chi nhánh, thực hiện đúng thủ tục báo cáo thuế chi nhánh hạch toán phụ thuộc và chuẩn bị đầy đủ hồ sơ kê khai thuế cho chi nhánh mới thành lập.
Nếu doanh nghiệp của bạn đang gặp khó khăn trong báo cáo thuế cho nhiều chi nhánh, hãy nhấc máy và liên hệ ngay hotline 0936 149 833 để nhận tư vấn trực tiếp từ các luật sư và chuyên gia kế toán giàu kinh nghiệm của Luật và Kế toán An Khang. Chúng tôi sẽ giúp bạn kê khai đúng, nộp thuế an toàn và tránh rủi ro pháp lý.
